宏基因組測序

1. 原始數據整理、過濾及質量評估

2. 基于物種豐度分析：
    ♦物種豐度列表
    ♦稀釋曲線

3. 基于物種豐度分析：
    ♦豐度分布曲線圖
    ♦生物多樣性指數（α多樣性）列表
    ♦物種豐度差異性分析列表
    ♦多樣品物種分布柱圖
    ♦豐度差異物種聚類分析
    ♦PCA圖
    ♦Krona圖

4. 基因豐度列表：
    ♦提取基因分級注釋豐度列表（KO、NOG、subsystem）
    ♦功能基因列表
    ♦生成venn圖
    ♦基因豐度差異性分析列表
    ♦豐度差異基因聚類分析
    ♦富集分析（KO）

5. 根據客戶需求進行個性化分析 

二、樣品要求 

1、樣品采集：樣品采集條件的一致是最為重要的環節，嚴格按照采樣標準采樣，采樣后立即封存樣品冷凍保存。 

2、樣品DNA：環境因素異常復雜，許多物質或抑制因子影響后續PCR、測序文庫構建和序列測定，常規提取方法不一定適合，建議采用專用試劑盒提取。PE文庫DNA濃度≥20 ng/μl，總量≥6 μg（熒光定量），并確保電泳檢測無明顯RNA條帶，基因組條帶清晰、完整；基因組DNA完全無降解；提供DNA電泳檢測照片，用自封袋密封后隨樣品一起送樣；組織樣品﹥1.5 g。

3、樣品保存期間切忌反復凍融。

4、送樣管務必標清樣品編號，管口使用Parafilm膜密封。

三、華津優勢

1.標準化的實驗室操作流程，經驗豐富的技術人員，可根據合作伙伴的要求解決實驗問題。

2.華津生物擁有多個先進的測序平臺，實驗周期短，質量可靠。

3.Illumina Miseq平臺參與宏基因組de novo測序，讀長較長，有利于拼接，且性價比高。