產品介紹
菌群多樣性組成譜測序研究
菌群多樣性組成譜測序以細菌/古菌 16S rRNA 基因可變區、真菌 18S rRNA 基因可變
區或真菌 ITS（Internal transcribed spacer）內轉錄間隔區等微生物特征序列（Signature
sequence）為靶點，通過檢測序列的變異和數量，反映菌群中各類微生物物種的身份和豐
度，從而快速解碼菌群物種分布特征，闡明樣本間多樣性和組成差異，進而發現差異相關物種。
產品特點
1. 直接對菌群樣本中的微生物特征序列進行擴增檢測，簡單快速且性價比高，并克服了絕大部分微生物無法純培養的難題；
2. 自動化、專業的 DNA 提取流程，配合高保真 DNA 聚合酶進行 PCR 擴增，并嚴格把控擴增循環數，確保菌群組成客觀真實；
3. 使用 Illumina MiSeq 的小型化測序平臺，周期更短，讀長更長（2´300 bp），每個樣本都能一次性獲得數萬條序列，即使低豐度物種也能精確定量；
4. 多種物種注釋數據庫可選，根據樣本來源按需選擇
Greengenes/Silva/HOMD/RDP/Unite/MaarjAM 等數據庫，最優化物種的分類鑒定；
5. 可對菌群進行代謝功能預測，通過組成數據，解讀潛在功能，并能指導后續宏基因組測序研究。
實驗流程
微生物組總 DNA 提取→目標片段 PCR 擴增→擴增產物檢測定量→測序文庫制備→上機進
行高通量測序
技術路線
典型分析結果展示
菌群物種分類組成的 Krona 交互展示圖
UniFrac PCoA 分析的樣本三維排序圖
LEfSe 組間差異物種的顯著性排序圖
LEfSe 組間差異物種的分類等級樹圖
RDA 約束排序圖
物種互作關聯網絡圖
值得一試的深度分析內容
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分析項目 |
分析要求 |
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CAP 主坐標典型相關分析 |
分組≥ 2 |
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菌群分型（Enterotype）分析 |
樣本≥ 20 |
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ROC 曲線建模驗證分析 |
分組≥ 2 |
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OTU—樣本二分網絡分析 |
樣本≥ 3 |
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物種——功能一致性 Circos 分析 |
樣本≥ 3 |
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